Magyarázat: A mutált koronavírus kontra tesztek, vakcinák

Új koronavírus kontra Covid-19 vakcinák és tesztek: Az Egyesült Királyságban keringő koronavírus-változatot számos mutáció határozza meg. Melyek különösen aggasztóak? Miért tanácsolta a WHO, hogy elkerülheti egyes PCR-teszteket, és vajon befolyásolhatja-e a vakcinázást?

A Pfizer-BioNTech Covid-19 vakcina fiola a londoni Guy's Hospitalban. Míg a vírus bizonyos területeken mutálódott, a legtöbb vakcina több részre irányul. (AP fotó: Frank Augstein)

Az Egyesült Királyságban keringő SARS-CoV-2 koronavírus új variánsáról szóló információk szerint egy mutáció különös aggodalomra ad okot. A VUI 202012/01 névre keresztelt változatot, amelyről azt számolták be, hogy gyorsabban terjed az emberek között, genetikai anyagában 14 mutáció és három deléció határozza meg. Különös aggodalomra ad okot egy mutáció, az N501Y. Míg a változatnak a tesztelési és oltási eredményekre gyakorolt ​​hatását még vizsgálják, az egészségügyi hatóságok nagyrészt optimisták, hogy a legtöbb teszt és vakcina továbbra is működni fog.

Mi az a mutáció?

A mutáció a genetikai anyag megváltozását jelenti. Egy RNS-vírusban, például a SARS-CoV-2-ben, a fehérjék aminosav-szekvenciákból állnak. Egy ilyen vírus mintegy 30 000 „bázispárt” tartalmaz, amelyek olyanok, mint a téglák, amelyeket egymás mellé raknak, hogy szerkezetet alkossanak. Ennek a bázisnak a megváltozása lehet egy mutáció, amely hatékonyan megváltoztatja a vírus alakját és viselkedését.

Az egyesült királyságbeli változatban egy mutáció miatt a vírus nagyobb valószínűséggel kötődhet a receptoroknak nevezett emberi fehérjékhez. Ezt N501Y-nek hívják.

Mi az az N501Y?

Egyszerű szavakkal, a koronavírus genetikai szerkezetében az 501. pozícióban lévő N betű által képviselt aminosavat ebben a pozícióban egy másik aminosavra cserélték, amelyet Y jelképez. Az a pozíció, ahol ez a változás megtörtént, a spike protein receptor-kötő doménje. (Ez a vírus tüskés fehérje, amely kötődik az emberi receptorhoz.)

Ezért a mutáció megnövelte a koronavírus kötési affinitását. A jelentések szerint a mutált vírus a legutóbbi londoni fertőzések 60%-áért felelős.

A Global Initiative on Sharing Avian Influenza Data (GISAID) adatbázisa szerint ugyanazt a mutációt a receptorkötő doménben egymástól függetlenül jelentettek több országban, köztük Dél-Afrikában és Ausztráliában. A szekvenciaelemzés kimutatta, hogy ez a mutáció külön-külön származik az Egyesült Királyságból és Dél-Afrikából.

Mi a helyzet a többi koronavírus-mutációval?

A mutációk gyakoriak, de többségük nem okoz változást az általuk kódolt fehérjék szerkezetében – ezeket „szinonim” mutációknak nevezzük, mivel végül ugyanazon aminosavakká alakulnak át. Egy másik típus a „nem szinonim” mutáció, amely aminosav változást eredményezhet.

Az Egyesült Királyságban keringő változatban hat szinonim elváltozás és tizennégy nem szinonim mutáció található. Ezen kívül van három „deléció” – a szekvenciából eltávolított aminosavak.

Az Egészségügyi Világszervezet (WHO) szerint az N501Y kivételével a P681H és a HV 69/70 mutációk, amelyek befolyásolhatják a vírus emberben való átvihetőségét.

És mi az a P681H és HV 69/70?

P681H : Ez a mutáció a 681-es aminosavban fordult elő – a receptorkötő domén egy másik pozíciójában. Itt a P aminosavat H-ra cserélték. Az US Centers for Disease Control (CDC) szerint ez egy olyan hely, ahol nagy a variabilitás a koronavírusok tekintetében, és ez a specifikus mutáció is többször spontán módon megjelent. A WHO szerint ez a mutáció biológiai jelentőségű.

A kutatók korábban kimutatták, hogy ez a mutáció elősegítheti a légúti hámsejtekbe való bejutást és állatmodellekben az átvitelt.

A nigériai Redeemer’s University Afrikai Fertőző Betegségek Genomikai Kiválósági Központjában a közelmúltban szekvenált minták kimutatták a P681H szekvenciát. A kutatók azonban azt mondják, hogy jelenleg nincs bizonyítékuk arra, hogy a P681H variáns hozzájárulna a vírus fokozott terjedéséhez Nigériában.

HV 69/70 : Ez a mutáció a 69. és 70. pozícióban lévő aminosavak deléciójának eredménye. Ezek a pozíciók ismét a vírus tüskeproteinjében vannak. Ezt a deléciót Franciaországban és Dél-Afrikában is megfigyelték. A CDC azt mondta: Ez a kettős deléció sokszor spontán módon megtörtént, és valószínűleg a tüskeprotein alakjának megváltozásához (azaz konformációs változáshoz) vezet.

A COVID-19 Genomics Consortium UK (CoG-UK) megbízásából, amely az Egyesült Királyságban az új változatot piros zászlóval jelölte, előzetes jelentésükben közölték, hogy ez a törlés a nercek okozta dániai járványban is megfigyelhető volt. Emberben ezt a deléciót egy másik mutációhoz, az N439K-hoz hozták összefüggésbe, amely ismét a receptorkötő domént jelentette.

A WHO kiemelte, hogy ez a törlés hatással lehet egyes, az új koronavírust kimutató RT-PCR tesztek teljesítményére.

Hogyan befolyásolhatja az RT-PCR teszteket?

A WHO azt mondta, hogy a 69/70. pozícióban lévő deléció befolyásolja egyes diagnosztikai PCR-vizsgálatok teljesítményét, amelyek „S-gén célpontot” (az „S” vagy tüskeproteinben) használnak. A WHO azonban azt is elmondta, hogy a legtöbb PCR-vizsgálat világszerte több célpontot használ, ezért a változat diagnosztikára gyakorolt ​​hatása várhatóan nem lesz jelentős.

A CDC is azt mondta, hogy a legtöbb kereskedelmi PCR-tesztnek több célpontja van, ahol kimutatják a vírust, így még ha egy mutáció érinti is az egyik célpontot, a többi PCR-cél továbbra is működni fog.

Valójában az új törzs által kiváltott fertőzést az Egyesült Királyságban is kimutatták a hagyományos RT-PCR teszttel.

A vírus S génjét célzó, házon belüli PCR-vizsgálatokat alkalmazó laboratóriumoknak szintén tisztában kell lenniük ezzel a lehetséges problémával. Az országok kimutatási kapacitására gyakorolt ​​hatás korlátozása érdekében javasolt a különböző vírusos géneket célzó párhuzamos vagy multiplex vizsgálati módszerek alkalmazása is, amely lehetővé teszi a potenciálisan felmerülő variánsok kimutatását – javasolta a WHO.

Befolyásolja-e az oltásfejlesztést?

A CDC szerint az Egyesült Államok Élelmiszer- és Gyógyszerügyi Hatósága (FDA) által jóváhagyott vakcinák poliklonálisak, és olyan antitesteket termelnek, amelyek a tüskefehérje több részét célozzák meg.

A vírusnak valószínűleg több mutációt is fel kell halmoznia a tüskeproteinben, hogy elkerülje a vakcinák vagy a természetes fertőzések által kiváltott immunitást.

A WHO pedig azt mondta: Laboratóriumi vizsgálatok folynak annak megállapítására, hogy ezek a vírusváltozatok eltérő biológiai tulajdonságokkal rendelkeznek-e, vagy megváltoztatják-e a vakcina hatékonyságát. Jelenleg nem áll rendelkezésre elegendő információ annak meghatározásához, hogy ez a változat összefüggésben áll-e bármilyen változással a klinikai betegség súlyosságában, az antitestválaszban vagy a vakcina hatékonyságában.

Oszd Meg A Barátaiddal: