Magyarázat: Hogyan működik a koronavírus (COVID-19) teszt

Hogyan keresi a PCR-teszt a vírust a tamponmintákban? Mennyi ideig tart? Hány mintát tesztel India naponta, és tesztelhet-e többet? Ha lehet, miért nem bővült még?

India jelenleg kétlépcsős, valós idejű PCR-t végez a SARS-COV-2 tesztelésére. (Reuters)

Mi a COVID-19-et okozó új koronavírus diagnosztikai tesztje?

A Az Indiai Orvosi Kutatási Tanács (ICMR) azt mondta, hogy kijelölt laboratóriumok a hagyományos valós idejű polimeráz láncreakció (PCR) tesztet fogja használni, amelyet a torok hátsó részéből vett tampon, az alsó légutakból vett folyékony mintán vagy egy egyszerű nyálmintán végeznek. Az ilyen teszteket általában az influenza A, influenza B és H1N1 vírus kimutatására használják.

Mi az a PCR teszt?

Olyan technikát használ, amely másolatokat hoz létre a DNS egy szegmenséről. A „polimeráz” azokra az enzimekre utal, amelyek a DNS másolatait készítik. A „láncreakció” a DNS-fragmensek exponenciális másolása – az egyik kettőre, a kettő négyre, és így tovább. Kary Mullis, a PCR-technikát feltaláló amerikai biokémikus 1993-ban megkapta a kémiai Nobel-díjat.

A SARS-COV-2 azonban egy RNS-ből álló vírus, amelyet DNS-vé kell alakítani. Ehhez a technika magában foglalja a fordított transzkripciónak nevezett folyamatot. A „reverz transzkriptáz” enzim az RNS-t DNS-vé alakítja. Ezután másolatokat készítenek a DNS-ről, és amplifikálják. A próbának nevezett fluoreszcens DNS-kötő festék mutatja a vírus jelenlétét. A teszt a SARS-COV-2-t is megkülönbözteti más vírusoktól.

Mennyi ideig tart a PCR folyamat?

A valós idejű PCR-ek a minták vizsgálatához szükséges időt 4,5 órára csökkentették a körülbelül 6 órával korábbihoz képest – mondta Dr. R. R. Gangakhedkar, az ICMR tudósa. A teljes átfutási idő azonban – a minták begyűjtésétől a jelentés kézbesítéséig – körülbelül 24 óra, és ennél rövidebbnek kell lennie – mondta.

Magyarázat: Öt lépés a koronavírus kimutatásához

Hogyan zajlik a teszt Indiában?

Indiában jelenleg kétlépcsős, valós idejű PCR-t végeznek a SARS-COV-2 tesztelésére – mondta Dr. V Ravi, a NIMHANS vezető professzora és a neurovirológiai osztály vezetője. Az első szakasz a humán koronavírusokban előforduló, a mintában esetleg előforduló genetikai elemek kimutatására szolgál. A második szakasz célja a csak a SARS-COV-2 vírusban jelenlévő specifikus gének tesztelése.

Március elejéig a kezdeti szűrés A koronavírus bármely típusának ellenőrzésére szolgáló tesztet minden laboratórium elvégezte, de a megerősítő PCR-t csak a Pune-i Nemzeti Virológiai Intézet végezte. Ezután a NIV Pune átvitte a technológiát (a megerősítéshez szükséges reagenseket) az összes laboratóriumba, hogy ne kelljen mintára eljutni egészen Pune-ig. Ez csökkentette a minták tesztelésére fordított időt, mondta Dr Ravi.

Koronavírus-teszt: Hamis vér látható a koronavírussal (COVID-19) megjelölt kémcsövekben ezen az ábrán, amely 2020. március 17-én készült. (Reuters illusztráció: Dado RuvicO

India elég sok számot tesztel?

India naponta 10 000 mintát képes tesztelni, jelenleg pedig körülbelül 600-700-at. Összehasonlításképpen, Dél-Koreában, amelynek átfutási ideje hasonló, naponta akár 20 000 mintát is tesztelnek, különösen olyan modelleket használva, mint például az áthajtásos tesztelési létesítményei.

A kormány azzal érvel, hogy ebben a szakaszban nem szükséges minden embert tesztelni. Az ország teszteli azt a csoportot, amelyet egyelőre tesztelnie kell – mondta Dr. Gangakhedkar. Ha helyi átvitelt választ, akkor eleget tesztelünk. Ha úgy gondolja, hogy létezik közösségi alapú átvitel, akkor az más kérdés. Még mindig nincs olyan bizonyíték, amelyről ne tudnánk, hogy az indexes eset hogyan szerezte meg ezt a fertőzést – mondta.

Az Express Explained már a Telegramon elérhető. Kattintson itt, hogy csatlakozzon a csatornánkhoz (@ieexplained) és naprakész a legfrissebb

Nem akarunk válogatás nélkül tesztelni, mert most mindenki tesztet kér. Valahol tehát racionalizálnunk kell… de az is fontos, hogy odafigyeljünk, nehogy lemaradjunk a közösségi átvitelről – mondta Dr. Nivedita Gupta, az ICMR tudósa egy múlt heti sajtótájékoztatón.

Mi lesz a stratégia, ha megtörténik a közösség átadása?

Az ICMR nyomon követi a közösségi átvitelre utaló jeleket, India 52 vizsgálólaboratóriuma mindegyike 20, súlyos akut légúti fertőzésben (SARI) szenvedő betegek véletlenszerű mintáját vizsgálja. Ezeknek a teszteknek az „első része” várhatóan szerdán jelenik meg. Az ICMR azt mondta, hogy abban az esetben, ha ezekből a megfigyelési tesztekből kiderül, hogy a közösségi átvitel esete kiderül, a kormány stratégiája teljesen más lesz.

Koronavírus-járvány: Egy újdelhi kórházban. (PTI fotó/fájl)

Vannak-e akadályok a tesztelés kiterjesztésének?

Egyes szakértők szerint a költségek potenciális akadályt jelenthetnek. Az ICMR tisztviselői egy konferencián elmondták, hogy a COVID-19 elsődleges vizsgálatának költsége 1500 Rs. Ha egy második tesztet kell végezni az első teszt eredményeinek megerősítésére, a teljes költség körülbelül 5000 Rs. Az egyik tisztviselő azt is elmondta, hogy a használt szondák, amelyeket Németországból importálnak, korlátozó tényező.

Miközben a vizsgálóközpontok számát növelték, a szondák behozatala is megugrott. A múlt héten India körülbelül 200 000 szondát akart importálni, míg hétfőn Dr. Gangakhedkar azt mondta, hogy a kormány körülbelül egymillió szondát tervez importálni.

Koronavírus-járvány: mikor és kit kell tesztelni

Lehet, hogy India másképp csinálja a dolgokat?

A Translational Health Science and Technology Institute India ügyvezető igazgatója, Dr. Gagandeep Kang szerint India pontosan azt kezdte megtenni, amit egy olyan országnak ajánlottak, ahonnan a betegséget importálták. Az országba érkezők kivizsgálása és nyomon követése, valamint a velük kapcsolatba kerültek megfigyelése azonban racionális és megfelelő megközelítés, ha az egyetlen kockázat a betegség behozatala volt, és az utánkövetés és vizsgálat 100 %, azt mondta.

De ami megtörténhet, az az, hogy ezzel a fertőzéssel már a tünetek megjelenése előtt is elszaporodhat, és nagyon kevés esetben előfordulhat, hogy soha nem lesznek tünetei, így átadhatja másoknak anélkül, hogy tudná, hogy fertőzött - mondta. Ez a fajta összetettség… szükségessé teszi, hogy elgondolkodjon egy tartalék stratégián, hogy megtudja, valóban kihagyott-e valamit – mondta. Többet is tehetünk.

Az ICMR felügyelet segíthet?

Az ICMR döntése jó lépés, de vannak olyan régiók, amelyeket egy ilyen gyakorlat kihagyna, mondta Dr. Kang. Ha minden héten tesztel minden influenza laboratóriumból mintát, akkor ha csak egy pozitívumot is talál, az azt jelzi, hogy sok mindent kihagyott – mondta.

Dr. Kang szerint matematikai modellezéssel meg lehet érteni, mi adna a kormánynak ésszerű esélyt annak azonosítására, hogy van-e már közösségi átvitel. Szerintem nagyszerű lenne egy olyan modell, mint Szingapúr, ahol bármely orvos, akinek klinikai gyanúja merült fel, még ha nem is felel meg a leírásnak, elküldhetné páciensét vizsgálatra – tette hozzá.

– Kaunain seriff M

Oszd Meg A Barátaiddal: