Magyarázat: Öt lépés a koronavírus (COVID-19) kimutatásához

A folyamatot Dr. V Ravi, a NIMHANS Neurovirológiai Osztályának vezető professzora ismertette a The Indian Express-nek.

A 2020. március 17-én készült illusztráción a koronavírussal (COVID-19) jelölt kémcsövekben hamis vér látható. (Reuters)

Dr. V Ravi, vezető professzor és a NIMHANS Neurovirológiai Osztályának vezetője elmagyarázza a koronavírus kimutatásának folyamatát. ezt a weboldalt . Íme az öt lépés:

Gyűjtés és szállítás

A vizsgálóközpont tamponokat vesz az orrüregből és a torok hátsó részéből (garat), és a mintákat vírusszállító közegbe helyezi, amely kiegyensúlyozott sókat és albumint tartalmaz, hogy megakadályozza a vírus szétesését. A mintát ezután hideg raktárban szállítják a vizsgáló laboratóriumba.

A vírus RNS extrakciója

Az olyan koronavírusok, mint a SARS-CoV (amely Kínában 2002-2003-ban jelent meg), a MERS-CoV (2012-ben jelent meg Szaúd-Arábiában) vagy a jelenlegi SARS-CoV-2, amely a COVID-19 világjárványt okozta, nagy kiterjedésű. , egyszálú RNS-genomok. A tesztlabor kivonja az RNS-t a mintákból a kereskedelemben kapható (például a QIAGEN-hez hasonló cégek által készített) készletek segítségével.

Az RNS behelyezése a PCR keverékbe

Az extrahált RNS-t polimeráz láncreakciós (PCR) keverékhez adják. Ez magában foglalja a „master mix”-et, amely egy „reverz transzkriptáz” enzimet tartalmaz, amely az RNS-t DNS-vé alakítja. A Master mix Taq polimerázt, azt az enzimet tartalmazza, amely a DNS másolatait, nukleotidokat, valamint más elemeket, például magnéziumot hoz létre – amelynek egy ionja szükséges a DNS amplifikálásához.

A PCR keverék „reagenseket” is tartalmaz, például „primereket” és „próbákat”. A primerek olyan DNS-szálak, amelyeket úgy terveztek, hogy kötődjenek a másolandó DNS-hez; próbákat használnak a DNS-mintában lévő specifikus szekvencia kimutatására. A WHO speciális primereket és szondákat javasolt a COVID-19 vizsgálatához.

Végül a PCR-keverék egy háztartási génből áll – egy normál emberi génből (RNáz P), amelyet a minták megfelelő gyűjtésének és az RNS extrahálásának biztosítására használnak.

A vírus DNS amplifikációja

A PCR-keverékben lévő mintát csövekbe vagy lemezekbe helyezik, amelyeket azután egy hőciklusos berendezésbe helyeznek, amelyet a PCR-folyamat végrehajtására használnak.

Először az RNS-t DNS-vé alakítják. Ezután megindul a gének másolásának folyamata. A termikus ciklusos felmelegíti és lehűti a keveréket a mintával, váltakozva három hőmérséklet között – a DNS megolvadásához a két szál elválasztásához, a primernek a DNS-hez való kötődéséhez és egy új szál szintéziséhez – mindezt egyetlen cikluson belül, amely egy ideig tart. perc. A thermocycler 30-40 ilyen ciklust futtat le, hogy felerősítse a DNS-t és ellenőrizze a vírust.

Ellenőrzési tesztek

Az amplifikált DNS-t pozitív kontrollal szemben tesztelik, amely általában a vírus plazmidba klónozott génjeiből áll, és egy negatív kontrollal, amely egy „ismert” minta, amely korábban negatívnak bizonyult a vírusra.

Az RNáz P-nek amplifikációt kell mutatnia, a pozitív kontrollnak pozitívnak, a negatív kontrollnak negatívnak kell lennie, és bármilyen eredményt kapunk is a mintára, az a helyes eredmény – mondta Dr. V Ravi neurovirológus. Ahhoz, hogy egy teszt érvényes legyen az eredmény közzététele előtt, bizonyos „érvényességi kritériumoknak” meg kell felelniük.

Ne hagyja ki az Explained | Hogyan működik a COVID-19 teszt

Ha a housekeeping gén (RNáz P) pozitív, a pozitív kontroll pozitív, a negatív kontroll negatív, és a minta nem mutat PCR-pozitív eredményt, a mintát negatívnak nyilvánítják a SARS-CoV-2 vírus RNS-ére. Ha a PCR eredménye pozitív, akkor a beteg COVID-19-fertőzött.

Oszd Meg A Barátaiddal: